进入游戏，首先出现的仍然是口袋界的权威人物，大村博士，他一如既往地先向各位训练师介绍有关口袋妖怪的基础性知识，等他的一长串演讲过后，就要选择主角的性别了，男（お&j84;&j87;）或女（おんな），各位根据自己的喜好选择吧（什么叫自己的喜好-_-!!!笔者选择了“英勇”的男孩）。选定了性别以后，再决定自己的名字，确定以后便正式进入游戏流程！
“咯噔——咯噔——”
主角小绿一觉醒来，发现自己睡在一间卡车的货舱当中，原来今天是搬到新家的第一天，同时也是自己开始口袋训练师旅行的第一天！过了一会，车停了下来，右边的货舱门打开了，向右走出卡车。刚从卡车上跳下，老妈就从新居走了出来。跟老妈对话后进入新家，看到居然有几只暴烈猿正在帮忙搬家具。从楼梯上到二楼，这里是小绿自己的房间，居然还有NGC，好豪华！面对墙上的时钟调查，可以调整时间，注意，绿宝石采用的仍然是实时游戏，所以游戏的时间和红蓝宝石一样也会影响到游戏里的一些剧情，可能的话还是玩时钟版的吧！设置好时钟以后，老妈会上楼来叫小绿下楼看电视，看了以后就可以自由行动了！
来到新住宅的第一件事当然是要先去拜访一下左邻右舍了！走出家门，进入到自家旁边的那栋房子，会有另一个母亲对你的到来表示热烈的欢迎，通过房间里的楼梯去二层。这里的房间居然没人？但是小绿看到地上放着个精灵球。难道这是自己取得第一只宠物的地方？而且只有一个？不管他，先上去拣……就在刚调查那个精灵球的时候，有个女孩冲了进来，果然有诈！一阵辩解之后小绿终于澄清了自己的误会，这时就可以从房间出去了。
小绿为了尽快得到自己心爱的宠物，可以先去拜访研究所，却发现博士没在，拿不到宠物，没办法，先向上走出村看看吧。谁料刚走出村庄，突然听到一声呼救，小绿急忙跑上前，却看到一向崇拜的博士居然正被一只针鼠追的乱跑。赶快帮忙！走上前去，调查丢在地上的背包，终于看到梦寐以求的宠物了！——草蜥蜴、小火鸡和水鳍鱼，看哪个适合自己就选哪个吧，笔者是带上了可爱的小火鸡。一旦选定使用的宠物马上就会进入第一场战斗，由于对方不强，应该可以比较容易取胜，也可以趁这个机会熟悉一下指令操作。战斗结束后，博士会带着小绿回到了研究所，同时就把刚才选择的宠物正式送给小绿了，小火鸡——得到了！博士还告诉小绿，他的孙女正在103号道路做考察，去找找她吧！
从博士的研究所出来，小绿现在可以直接从上方的出口出村了，路上的草丛里会出现一些野生宠物，可以多打一些练练级。小绿一直向上不远便来到第一个城市コトキタウン，在这里有PC中心可以回复宠物的体力，还有SHOP可以买到道具。略做休息之后，小绿再继续向上走便来到了103号道路，可是居然看到刚才在房间遇到的那个女孩在这里！难道她就是——！
小绿走过去跟她说话，没想到她二话没说就居然先要跟小绿进行宠物对战！可是刚刚已经练过级的小绿又怎么会怕她？上！轻松摆平她以后她就会回去了，跟上她，一直向下回到最初的村子里，去博士的研究所，这时博士和女孩都会在那里等小绿了。跟博士对话后博士会把珍贵的宠物精灵图鉴送给小绿，同时，还把自己的孙女也就是刚才的女孩正式介绍给了小绿，从此，小绿和女孩就是相互竞争的劲敌了！女孩也拿出5个精灵球送给了小绿做为见面礼，不过这个女孩也会在将来的道路上帮助和挑战小绿，要小心哦！走出博士的研究所，小绿看到妈妈正站在家门口，怎么了？走过去，妈妈把小绿叫住，并交给了他一双跑鞋，哦耶！得到跑鞋以后，按住B键再按方向键就可以奔跑前进了，再不用忍受那慢吞吞的蜗牛速度了！而小绿的口袋训练师之路，从此也算是真正展开了！
从自己的村子ミシロタウン出发，小绿已经可以开始捕捉自己的宠物了，不妨多抓几只带在身上，如果有什么比较难缠的对手的话，群殴和单挑的好处不用多说吧^_^！向上来到刚才已经来过的第一个城市コトキタウン，这时候左边挡路的家伙已经不在了，向左前进！路上有不少训练师会向小绿发起挑战，以现在的等级，摆平他们应该是比较简单的事情。之后便会来到下一个城市トウカシティ。这里会出现第一个道馆GYM，只可惜暂时还不能挑战……不过也先别急着走，既然来了就先去拜访一下好了，进入GYM，竟然发现老爹是这里的道馆主！以小绿现在的实力还真不够挑战的资格……跟老爹对话以后会闯进来一个少年，似乎也是来挑战的，不过他的实力也……然后这个男孩会带着小绿去学习怎么抓野生宠物，如果还不会使用精灵球捕捉宠物的话在这里就可以认真看一看了，全自动的哦！学习完以后回到老爹的道馆，寒暄以后出去就能继续向左出发了。正在小绿要出城的时候，被一个带墨镜的陌生男子叫住了，他是谁？说了一堆奇怪的话后，墨镜男先走了。不管<
